Физиологик шартларны охшату тикшерүчеләргә металл бәйләүчеләрне табарга булыша
Тикшерүчеләр металл ионнарын бәйләгән кечкенә молекулаларны ачыклау ысулын уйлап таптылар. Металл ионнары биологиядә бик мөһим. Ләкин нинди молекулаларның, һәм аеруча нинди кечкенә молекулаларның - металл ионнары белән үзара бәйләнешен ачыклау авыр булырга мөмкин.
Анализ өчен метаболитларны аеру өчен, гадәти метаболомика ысуллары органик эреткечләрне һәм түбән рН кулланалар, бу металл комплексларның аерылуына китерә ала. Сан-Диегодагы Калифорния Университеты Питер Доррестейн һәм хезмәттәшләре күзәнәкләрдәге туган шартларны охшатып анализлау өчен комплексларны бергә тотарга теләделәр. Ләкин молекулаларны аеру вакытында физиологик шартлар кулланган булсалар, алар сынап карарга теләгән һәр физиологик шарт өчен аеру шартларын яңадан торгызырга туры килер иде.
Моның урынына, тикшерүчеләр гадәти хроматографик аеру һәм масса спектрометрик анализ арасында физиологик шартлар кертә торган ике этаплы алым уйлап таптылар (Нат. Хим. 2021, DOI: 10.1038 / s41557-021-00803-1). Беренчедән, алар гадәти югары җитештерүчән сыек хроматография ярдәмендә биологик экстрактны аердылар. Аннары алар хроматографик баганадан чыккан агымның pH-ны физиологик шартларга охшаттылар, металл ионнарын куштылар һәм массаны спектрометрия белән анализладылар. Анализны металл белән һәм аннан башка кечкенә молекулаларның масса спектрын алу өчен ике тапкыр үткәрделәр. Кайсы молекулаларның металлны бәйләгәнен ачыклау өчен, алар исәпләү ысулын кулландылар, алар чикләнгән һәм чикләнмәгән версияләр спектры арасындагы бәйләнешне табу өчен иң югары формаларны кулланалар.
Доррестейн әйтүенчә, физиологик шартларны охшатуның бер ысулы - натрий яки калий кебек ионнарның югары концентрацияләрен һәм кызыклы металлның аз концентрацияләрен өстәү. “Бу конкурс экспериментына әйләнә. Бу, нигездә, сезгә әйтер, ярый, бу молекуланың натрий һәм калийны яисә сез кушкан бу уникаль металлны бәйләү мөмкинлеге күбрәк, "Доррестейн әйтә. "Без бер үк вакытта күп төрле металл куя алабыз, һәм без бу контексттагы өстенлекне һәм сайлап алуны аңлый алабыз."
Эшеричия коли культурасыннан алынган экстрактларда, тикшерүчеләр, йерсиниабактин һәм аэробактин кебек тимер бәйләүче кушылмаларны ачыкладылар. Ерсиниабактин очракта алар цинкны бәйли алуын ачыкладылар.
Тикшерүчеләр үрнәкләрдә металл бәйләүче кушылмаларны океаннан эретелгән органик матдәләр кебек катлаулы дип билгеләделәр. "Бу мин караган иң катлаулы үрнәкләрнең берсе", ди Доррестейн. "Бу, мөгаен, нефтькә караганда катлаулырак булмаса, мөгаен." Бу ысул домой кислотасын бакыр бәйләүче молекула итеп билгеләде һәм Cu2 + ны димер итеп бәйләргә тәкъдим итте.
"Барлык үрнәктә металл бәйләүче метаболитларны ачыклау өчен омик алым биологик металл челатының мөһимлеге аркасында бик файдалы", дип яза Оливер Барс, Төньяк Каролина дәүләт университетында үсемлекләр һәм микроблар җитештергән металл бәйләүче метаболитларны өйрәнүче. электрон почта.
"Доррестейн һәм хезмәттәшләре зәвыклы, бик кирәкле, күзәнәктә металл ионнарының физиологик ролен яхшырак тикшерү өчен анализ ясыйлар", - дип яза Утрехт Университетының массакүләм спектрометрия анализы пионеры Альберт Дж.Р. Хек. "Киләсе адым - метаболитларны күзәнәктән чыгару һәм аларны шулай ук туган шартларда фракцияләү, нинди метаболитларның нинди эндоген кәрәзле металл ионнарын йөртүен карау."
Химия һәм инженер яңалыклары
ISSN 0009-2347
Copyright © 2021 Америка химия җәмгыяте
Пост вакыты: 23-2021 декабрь