Identifying metal-binding small biological molecules

Физиологик шартларны охшату тикшерүчеләргә металл бәйләүчеләрне табарга булыша

Тикшерүчеләр металл ионнарын бәйләүче кечкенә молекулаларны ачыклау ысулын уйлап таптылар.Биологиядә металл ионнары мөһим.Ләкин нинди молекулаларны, һәм аеруча кечкенә молекулаларны - металл ионнар белән үзара бәйләнешне ачыклау авыр булырга мөмкин.

Анализ өчен метаболитларны аеру өчен, гадәти метаболомика ысуллары органик эреткечләрне һәм түбән рН кулланалар, бу металл комплексларның аерылуына китерә ала.Сан-Диегодагы Калифорния Университеты Питер Доррестейн һәм хезмәттәшләре күзәнәкләрдәге туган шартларны охшатып анализлау өчен комплексларны бергә тотарга теләделәр.Ләкин молекулаларны аеру вакытында физиологик шартлар кулланган булсалар, алар сынап карарга теләгән һәр физиологик шарт өчен аеру шартларын яңадан торгызырга туры килер иде.

Моның урынына, тикшерүчеләр гадәти хроматографик аеру һәм масса спектрометрик анализ арасында физиологик шартлар кертә торган ике этаплы алым эшләделәр (Нат. Хим. 2021, DOI: 10.1038 / s41557-021-00803-1).Беренчедән, алар биологик экстрактны гадәти югары җитештерүчән сыек хроматография ярдәмендә аердылар.Аннары алар хроматографик баганадан чыккан агымның pH-ны физиологик шартларга охшаттылар, металл ионнарын куштылар һәм массаны спектрометрия белән анализладылар.Алар металл белән һәм аннан башка кечкенә молекулаларның массив спектрын алу өчен ике тапкыр анализ ясадылар.Кайсы молекулаларның металлны бәйләгәнен ачыклау өчен, алар исәпләү ысулын кулландылар, алар чикләнгән һәм чикләнмәгән версияләр спектры арасындагы бәйләнешне табу өчен иң югары формаларны кулланалар.

Доррестейн әйтүенчә, физиологик шартларны охшатуның бер ысулы - натрий яки калий кебек ионнарның югары концентрацияләрен һәм кызыклы металлның аз концентрацияләрен өстәү.“Бу конкурс экспериментына әверелә.Бу, нигездә, сезгә әйтер, ярар, бу молекуланың натрий белән калийны бәйләү мөмкинлеге күбрәк, яки сез кушкан бу уникаль металл, "Доррестейн әйтә."Без бер үк вакытта күп төрле металл куя алабыз, һәм без бу контексттагы өстенлекне һәм сайлап алуны аңлый алабыз."

Эшеричия коли культурасы экстрактларында, тикшерүчеләр, йерсиниабактин һәм аэробактин кебек тимер бәйләүче кушылмаларны ачыкладылар.Ерсиниабактин очракта алар аның цинкны бәйли алуын ачыкладылар.

Тикшерүчеләр үрнәкләрдә металл бәйләүче кушылмаларны океаннан эретелгән органик матдәләр кебек катлаулы дип таптылар."Бу мин караган иң катлаулы үрнәкләрнең берсе", ди Доррестейн."Бу, мөгаен, нефтькә караганда катлаулырак булмаса, мөгаен."Бу ысул домой кислотасын бакыр бәйләүче молекула итеп билгеләде һәм Cu2 + ны димер итеп бәйләргә тәкъдим итте.

"Барлык металл бәйләүче метаболитларны үрнәктә ачыклау өчен омик алым биологик металлны чистартуның мөһимлеге аркасында бик файдалы", дип яза Оливер Баарс, Төньяк Каролина дәүләт университетында үсемлекләр һәм микроблар җитештергән металл бәйләүче метаболиталарны өйрәнүче. электрон почта.

"Доррестейн һәм хезмәттәшләре зәвыклы, бик кирәкле, күзәнәктә металл ионнарының физиологик ролен яхшырак тикшерү өчен анализ ясыйлар", - дип яза Утрехт университетының туган массакүләм спектрометрия анализы пионеры Альберт Дж."Чираттагы адым метаболитларны күзәнәктән чыгару һәм аларны шулай ук туган шартларда фракцияләү, нинди метаболитларның эндоген кәрәзле металл ионнарын йөртүен карау."

Пост вакыты: 23-2021 декабрь